1. Sería más fácil manejar la siguiente estructura:
/index.html
/noticias.html
/vides.html
/etc.html
/archivos_comunes/menu.html
/archivos_comunes/cabecera.html
/archivos_comunes/pie.html
así en cada página.html solo cargas a los archivos comunes... creo que sería más fácil..
Para que no tengas problemas con los menús, pues en los enlaces pon las rutas absolutas:
<a href="http://www.tusitio.com/noticias.html">Noticias</a>
2. <a href="url" target="_blank">Enlace</a>
Saludos