Pueden ser los codec, si tienes un lío de codecs pues no se te reproducirán bien las pelis... La solución sería desinstalar todos los packs de codecs (elisoft) y los codec sueltos que tuvieras instalados (como el divx), reiniciar, y luego instalarte sólo los necesarios y uno a uno:
http://codecs.mundodivx.org
También puedes probar con el reproductor videolan vlc, o media player classic.
Espero que te sirva