Código PHP:
$markedImage="./micarpeta/marca".$image;
hice unas pruebas, y me creo la imagen sin problemas. Lo unico qu eme dio problemas fue la funcion realpath con la estructura header. asi que quita la llamada la funcion y dejalo como lo he puesto.
Con eso debe de funcionar, a menos que por alguna razon no se esten creando adecuadamente tus imagenes.