Buenas, yo para instalar una aplicación asp.net en el servidor. Lo que hago es copiar la aplicación dentro del IIS, que normalmente suele estar en c:\inetpub\wwwroot
Y para instalar los crystal reports y exportarlos a pdf, yo lo que hago es instalar el adobe en el servidor y dar permisos de escritura a la carpeta donde creo los informes, y con esto, ya me funciona.
Espero que te sirva