Puedes en principio crear todas tus conecciónes y asignarle una referencia:
http://www.forosdelweb.com/f18/conexion-7-bases-datos-mismo-tiempo-285587/
Y para ejecutar la query podrías igual hacer un ciclo para que se ejecute en cada una de las conexiones:
Código PHP:
for($i=0; $i<count($conexiones); $i++) {
// creo en este caso sería mejor usar mysql_db_query ¿no?
mysql_db_query("B_D", $query, $conexiones[$i]);
}
La idea general... supongo igual tendrías que guardar los nombres de la BD en una matríz.. no sé!.
Suerte y bienvenida!