Si dices q ya reinstalaste el S.O. pues deberia funcionar, y si no es asi, de nada serviria tratar de examinar le disco duro, pues t sale 0 sectores defectuosos, supongo q el sector de arranque de tu Disco duro es el causante.
Podrias arreglar el registro desde 0.
o deberias formatear desde 0 el S.O. pues como dijiste ya reinstalast el windows y persiste el problema, si lo formateas no perderias nada .
suerte