Aca es donde estas confundido Instru, cl archivo.cpp y ya esta
Solo tenes que tener bien configurados los path, suele venir un archivo VCVARS32.BAT al que suelo renombrar por VC++.BAT y dejarlo en C:\ para mayor comodidad, este archivo configura el path para poder usar los includes, el compilador, el enlazador (link.exe) y mas herramientas como dumpbin.exe que es muy util.