... eeeehhhh... te recomiendo leerte un poco más sobre PHP.. es básico el saber cómo trabaja... y creo se mencionó de forma clara... pero leete esto:
www.php.net/basic-syntax .
Respecto a tu código... puedes hacerlo de variaas maneras:
1) Guardando el formato dentro de la misma variable... poco recomendable y definitivamente incorrecto si dichas variables no llevarán el mismo formato.. pero sería algo como:
Código PHP:
if($new1 = fopen('news1.php', 'r')){
$cont=1;
$noti1="<b>"; // estás dando una etiqueta <b> al inicio de la cadena
while(!feof($new1)){
$noti1 = $noti1."<br>".fgets($new1, 4096); // aquí se acomula el contenido
}
$noti1.="</b>"; // y finalizas con el cierre de la etiqueta.. entonces TODO el contenido esta entre dichas etiquetas....
}
2) Y más correcto... y que se mencionó aquí.. darle formato a la hora de imprimir:
Código PHP:
//// Tu código "hace lo que hace"...
if(....){
while(...) { .... } // solo ilustro
}
///// entonces aquí tienes tu $noti1 con todo el contenido y quieres mostrarla con formato... entonces...
echo "<br>$noti1</b>"; // todo $noti1 entre etiquetas <b>... sencillo.
3) Y que mencioné podría resultante conveniente.. que se maneja en las FAQ... y que explican en el enlace que dejé... es insertar el código PHP dentro del HTML que ya tiene el formato:
Código PHP:
<?php
// tu código... creas tu variable $noti1;
// sales de PHP y tienes el HTML adecuado:
?>
<b><?=$noti1 ?></b>
<?php
// puedes volver a entrar a PHP cuantas veces quieras.. y el HTML es visible en editores viduales de HTML como DW... lo que le da ciertas ventajas...
// por ejemplo puedes trabajar con CSS de forma mucho más eficiente... ñlo que te plantearon antes
?>
Ejemplos muy sencillos y utilizando una etiqueta obsoleta (<b>) solo por comodidad de mi parte... espero te quede claro...
Suerte!

PD: Lo de tu dominio es porque así está configurado desde el servidor...