no se si se puede usar case en Access, y en la ayuda tampoco he encontrado nada, pero para lo que tú utilizas la consulta hay una función nvl para Oracle y en Access es Nz que hace lo que tú quieres, la consulta quedaría algo así
Código:
SELECT FORMAT(FechaFactura,'dd/mm/yyyy') AS Fecha,
NumFactura AS Factura, NumCliente AS Cliente, (Nz(Importe,0)+Nz(IVA,0)) AS Total
FROM Facturas WHERE......
también podrías hacer varias consultas unidad por un union considerando los distintos casos
espero que te sirva