Mi experiencia personal, fue eso, pasar las particiones NTFS a FAT32 del Win XP y listo, problema solucionado. Hasta comparto los directorios de download del aMule (Linux) y eMule (Win) y ambos pueden continuar lo que estaba bajando el otro
Es mas, si ven mis post por ahi, tuve un problema al instalar el Linux que modifico la estructura logica del disco rigido y el win XP no inicio mas, lo tenia iniciando de disquete!!! Pero al pasar la particion a FAT32, magicamente se arreglo el booteo y puedo arrancar Windows sin problemas.
No creo que un usuario hogareño necesite de la "seguridad" ofrecida por NTFS
Solo una opinion, Saludetes