La casilla de two-pass sirve para codificar el vídeo en dos pasadas. En la primera se analiza el vídeo y si mira dónde se necesita más bitrate y dónde menos, y en la segunda ya se codifica. Es muy recomendable que la actives... aunque el tiempo total de codificación será el doble, pero la calidad debería mejorar aun utilizando bitrates más bajos. El bitrate de 9000, si te sirve (por el tamaño final del fichero) pues OK, si no, puedes bajarlo hasta 6000, pero en ese caso tienes que utilizar las dos pasadas