A la capa se le aplica una coordenada que parte del eje supeior izquierdo:
Por ejemplo:
Cita: <div id="Layer1" style="position:absolute; left:190px; top:102px; width:328px; height:138px; z-index:1"></div>
Ahí puedes ver una capa que está situada a 190 pixeles desde el márgen izquierdo y a 102 pixeles del margen superior.
¡Suerte!
Jose María