En softonic tienes muchos programas para hacerlo:
http://www.softonic.com/seccion/213/Alta_en_buscadores
En la pestaña 'Ver sólo' puede elegir que te muestre sólo los gratuitos.
Úsalos con precaución, a algunos buscadores no les gusta que des de alta una web varias veces.
Puedes añadir tu web a google desde:
http://www.google.es/addurl/
También conviene que la des de alta en
http://dmoz.org/
Muchos buscadores usan internamente estos dos últimos, con eso te aseguras que aparecerás en varios sin hacer nada más...