A que te refieres con su servidor,al cassini???
Yo emepece yutilizando este servidor pero luego tube q pasarme al iis para crear mis aplicaciones....
entonces dices que utilizas una carpeta comun,supongo q con su we.confg.
Creas el directorio virtual en el iss???
Otra cosa el iss hay q instalarlo antes de instalar el framework,yo tube problemas con eso,tube q reinstalarlos por q me daba un error.Pero tu dices que no te da error
Mira bien los permisos del direcotio virtual.