Compadre...
A) Nada que ver con el javascript (hasta donde dan mis conocimientos un cliente en javascript
)
B) Ademas para su manipulacion de datos de un cliente de email aun que sea lo mas basico se debe de hacer del lado del servidor, en este caso utiliza Lenguaje del lado del servidor como PHP, ASP, CGI, etc para su manipulacion.
Mira aqui tienes un cliente de email con su codigo fuente, donde lo puedes manipular...
SquirrelMail
no te preocupes de la licencia es OPEN...