Hola:
Un archivo .pl y un .cgi viene a ser lo mismo. Un archivo .cgi tiene como primera línea la ruta donde se encuentra el intérprete (el de Perl en tu caso) ya que se llama desde el servidor web. Un archivo .pl no se si la lleva (el archivo .pl es llamado desde la línea de comandos). La línea que contiene la direccion del intérprete creo que era algo así:
#! usr/bin/perl
sustituyendo la dirección que he puesto por la real donde se encuentra el intérprete Perl. Si ya la tienes, limítate a cambiar la extensión por .cgi y asegurarte de que tanto el archivo como el directorio que lo contiene tienen permiso de ejecución.
Un saludo
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