En PHP puedes conectarte a servidores LDAP .. creo que Windows 2000 también puede usar como BD de usuarios/cuetas un servidor LDAP . .así que si puedes hacer es´, podrías usar comodamente PHP con las funciones
www.php.net/ldap .. en su defecto podrías probar con COM (
www.php.net/com).
Revisa en los comentarios de los usuarios de las funciones LDAP por "Active Directory" (parece que en el fondo ese es el nombre que le da a "LDAP" en windows?) .. tienes ejemplos ...
Un saludo,