Perdon q me meta donde no me llaman (no soy experto) ...
Como consejo .. podrias mirar alguna classe ya implementada para subir ficheros:
Podrias mirar por aqui, aqui tienes muchas classes para manejo de directorios y ficheros (uploads):
<a href='ir.asp?http://www.phpclasses.org/browse.html/class/17.html' target='_blank'>http://www.phpclasses.org/browse.html/cl...</a>
Y ..en <a href='ir.asp?http://www.phpbuilder.com' target='_blank'>www.phpbuilder.com...</a> creo q tambien tienes un tutorial sobre como hacer Uploads.
Un saludo, disculpen si me meti donde no debia
