Desesperación con la maquetación....

[jesusbet]

Primero, te recomiendo tener un ancho definido para tu layout, por ejemplo, 730px, eso lo divides en la cantidad de columnas que tendrás al mismo nivel y debe ajustarse perfectamente.. mientras tanto, prueba con esto:
#cabecera{
position:relative;
width:100%;
height:35px;
background-color:#009966;
}

#menu{
position:relative;
float:left;
width:150px;
height:400px;
background-color:#9966CC;
}

#contenido{
position:relative;
float:left;
width:400px;
height:400px;
background-color:#FFCC00;
}

#cderecha{

float:right;
width:150px;
background-color:#9966CC;
height:400px;
}

#pie{
position:relative;
width:100%;
height:35px;
background-color:#009966;
clear:both;
}

no lo probé, pero debe funcar...

saludos