Para evitar ese tipo de problemas debes utilizar un limpiador de registro, ya q los programas cuando se desinstalan dejan claves, como tu mismo mencionaste, en el registro y eso fue posiblemente lo q origino el conflicto entre las versiones de Office, como no quieres tampoco limpiar el registro manualmente existen programas q lo limpian automaticamente como el
Regseeker pruebalo y comprueba los resultados, te sera de mucha utilidad esta herramienta, suerte