Hola, en PERL hay un módulo que se llama DBI que te conecta a cualquier base de datos, así cuando tenes tu programa podrás mudarlo de base de datos solo cambiando el nombre del driver...En excelente tutorial que te explica como conectarte a un base de datos es:
http://perlenespanol.baboonsoftware....ut/000045.html
Espero que te sirva
Saludos