Primero, en el codigo que pusiste hay un error:
donde dice
ref="icono.ico" debe decir
href="incono.ico"ds
Despues, tenes que asegurarte de que el icono sea multiple (por ponerle algun nombre), o sea, que tenga tamaños y colores de: 32x32x256, 32x32x16, 16x16x256 y 16x16x16 (los standard).
Una vez hecho esto, para que en IE se vean tenes que agregar el sitio en favoritos, sino no lo muestra.
En otros navegadores, como Mozilla, los muestra sin necesidad de agragarlo a favoritos.
<table width="100%" border="0" cellspacing="0" cellpadding="2"><tr><td align="center"><a href="http://www.cicpm.org" target="_blank"><img src="http://www.amsystems.com.ar/imagenes/fw/firma2.gif" border="0"></a></td></tr></table>