Tu MP3 está bien, no es problema de daños. El problema es de que las empresas que fabrican cosas que tengan capacidad de almacenamiento (DVDs, discos duros, reproductores mp3) miden la capacidad en sistema decimal y no en binario, porque así la capacidad aparente es mayor.
Un ejemplo. Tu reproductor te lo venden como de 512 MB, pero realmente lo que te están vendiendo es un reproductor con una capacidad de 512.000.000 bytes, o sea 512 millones (mega) de bytes, pero medidos en sistema decimal. Si lo pasas a MB reales, o sea dividiendo dos veces por 1024, salen los 488 MB que te marca windows.
No te molestes ni en reclamar porque todo esto de "engañar" al consumidor parece que es legal :-p
Saludos