en efecto, puedes usar porcentajes (por ejemplo: top:10%) o posicionarla usando position:relative en un contenedor (ya sea una tabla, un div o el body) y position:absolute en tu div. por ejemplo:
#div1{
position:relative;
}
#div2{
position:absolute;
top:20px;
left:25px;
}
<div id="div1">
<div id="div2">este div esta posicionado relativo a #div1</div>
</div>