Pues facil... todos los que usamos MC y hemos tenido que insertar estos en otros MC, debimos aplicar un nivel a estos. Ese nivel puede ser el 1, el 2, el 3, o cualquier otro, incluso el nivel 0 que es el root o principal.
Pues imagina que necesitamos poner un MC encima de otro (como el caso de los mapas), con swapDepths lo que hacemos es cambiarle el nivel y elevarlo a uno superior al actual.
Cuando Borix69 aplico "this.swapDepths(this.getDepth()+100)" a los mapas, lo que hizo fue sumarle 100 al numero del nivel actual que tiene el mapa en cuestion (this.getDepth), dando la apariencia de ponerse encima.