Creo que lo que debes hacer es cambiar el tamaño del fondo para los dos .fla (de manera que queden iguales) y abrir el .fla de la película pequeña y anda acomodando la pelicula dentro del .fla y comparando con la otra hasta que veas que no se te encima la pequeña sobre la grande y ahi exportas la pequeña y luego haces el loadmovie en la grande y listo...
Podría funcionar....
Espero que te sirva para algo.