No entiendo mucho lo que necesitás, pero el mensaje con aceptar y cancelar se llama usando confirm:
Código HTML:
<script type="text/JavaScript">
alert("Este E-mail ya existe en el Sistema y esta activo.")
confirm("¿Gusta que le mandemos su contraseña a su cuenta de correo electronico?")
</script> Devuelve TRUE si eligen Aceptar y FALSE si eligen cancelar.
Suerte
Fede