Estuve investigando un poco por que me quedó la curiosidad, ya que tambien estaba tratando de hacer una web con un flash transparente, y efectivamente en firefox no funcionaba. Resulta que para los navegadores que no sean IE, además de el tag:
<param name="wmode" value="transparent>
hay ke agregar un pequeño código al tag de embed.. que es algo asi...
<embed....(ya saben todo lo que lleva el embed) wmode="transparetn">
Con ese wmode funcionará, al menos probado en firefox...
