Y .. como gererastes PDF's antes? .. usastes PDF Lib? o que exactamente ..
Si no quieres depender del S.O. del servidor .. ni de que servidor HTTP usas . .o que versión de PHP .. o de requerimientos extra instalados en el servidor (extensiones como PDF Lib) .. puedes usar algunas classes como:
FPDF
http://www.fpdf.org
(está bien documentada y tiene cantidad de ejemplos: traduccidos incluso al castellano)
R&OS
www.google.com -> R&OS (ahora no tengo el link a mano)
(poca documentación)
Es cosa que las pruebes y decidas ..
Un saludo,