Otra cosa que he pensado que te puede ayudar mucho: si pones un atributo title a los span, como en este ejemplo:
Código PHP:
Este <span class="verbo" title="Verbo">es</span> un <span class="substantivo" title="Substantivo">text</span> de prueba
podrás ver como aparece una etiqueta con el texto de title que ayudaría a reforzar el código de colores, o incluso se puede usar para cosas más complejas, como hacer referencia a el fragmento en el otro idioma. (sólo lo he probado en Firefox y Safari pero supongo que funcionará en Explorer)