pero seleccionar de dónde? cuándo? cómo?
Depende de cómo lo muestres en pantalla... para ver cómo recojes los valores a comparar... después pasas esos valores por una función con una condicional... si son iguales muetras el mensaje... mira.. con checkbox sería algo así:
Código:
<html>
<head>
<script language="javascript">
function valida() {
var a= document.getElementById('1').checked;
var b= document.getElementById('2').checked;
if(a==true && a==b) alert("No válido");
return false
}
</script>
</head>
<body>
<form>
<input name="1" type="checkbox" id="1" onClick="valida()" value="checkbox">
Valor1<br>
<input name="2" type="checkbox" id="2" onClick="valida()" value="checkbox">
Valor2
</form>
</body>
</html>
Ahí solo comparos dos checkbox por lo que no hay problema asignarles sus valores directamente a unas variables.... ... pero puede cambiar mucho ó poco dependiendo de lo que tengas... Así que espero al menos te sirva como idea
Suerte!