Hola de nuevo.
Ya he encontrado la solucion

y es que ante la adversidad no hay nada como estrujarse el "tarro"

(sobre todo yo que soy un torpe

).
Es mas facil de lo que pensaba coloco el codigo para navegantes.
Código PHP:
reset ($DIRECTORIOS);
for( $i=0;$i<=count($DIRECTORIOS);$i++ ) {
reset ($excludedir);
for ($a=0;$a<=count($excludedir);$a++) {
if ($DIRECTORIOS[$i]==$excludedir[$a]){
array_splice($DIRECTORIOS,$i,1);
}
else{
}
}
}
Gracias y un Saludo