Hola hadez :)
En primer lugar Perl no es compilado, es interpretado.
Lo que me parece que te falta hacer, es marcar la carpeta en la que residen tus scripts con permisos de ejecucion (secuencia de comandos y ejecutables)
Eso lo hacés desde las propiedades de la carpeta con el "Administrador de servicios de Internet"
Suerte