Mira, cuando instalas los ffdshow, que por cierto instala
esta versión si no es la que tienes, se crean una serie de accesos directos, debes entrar al de configuración (no sé el nombre exacto pq yo tengo otra versión de ffdshow de pruebas).
Los ffdshow al instalarse quedan en inglés, si los quieres en español, en el menú de la izquierda busca "Tray, dialogs and paths" y ahí tienes para cambiar el idioma.
En el menú izquierdo hay un apartado llamado Codecs, ahí activas los codec que quieras, que serán los que usen tus pelis. Es decir, si tus videos por ejemplo usan los codec divx y xvid, basta que los actives (marcar la opción libavcodec), como en la imagen:
http://img14.imgspot.com/?u=05/73/11/ffdshow1.JPG
Para saber qué codec de video usa una peli, lo mejor es que uses el GSpot:
http://codecs.mundodivx.org
Luego para el filtro del logo pues mejor mira esta imagen, es muy sencillo y está todo bastante intuitivo:
http://img14.imgspot.com/?u=05/73/11/ffdshow2.JPG
Con AVI funciona seguro, lo que no sé es si funcionará con MPG activando el codec correspondiente, eso pruebalo si quieres.
Espero que esté ya más claro