Isaacluz si se puede.
tienes que poner la propiedad dentro de la etiqueta embed
Código:
<EMBED src="tu.swf"
WIDTH="ancho"
HEIGHT="alto"
quality=high
bgcolor=#FFFFFF
TYPE="application/x-shockwave-flash"
PLUGINSPAGE="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer"
wmode="transparent">
</EMBED>
PD. Opera aun no soporta swf tranparentes