Bueno, yo no soy un experto . y los proyectos que realizo no son de demasiada embergadura..
Personalmente prefiero usar clases bien definidas . una pora cada funcion que nesite y solo "diagamos compilar" las que realmente se usen en cada proyecto .. .. tanto para el tema de separar codigo de diseño, como otras utilidades y procesos habituales en el diseño y programacion de webs dinamicas.
Aqui les dejo este sitio para q vean clases (solo clases):
<a href='ir.asp?http://www.phpclasses.org' target='_blank'>http://www.phpclasses.org...</a>
Un saludo,